1993年获得控制理论与控制工程学科硕士点授权，2003年获得控制工程(工程硕士) 专业学位授权，2005年获得检测技术与自动化装置学科硕士点授权，2010年获得控制科学与工程一级硕士授权。学科主要以“控制理论控制工程 (081101)、“检测技术与自动化装置 (081102) ”、 “模式识别与智能系统（081104）” 三个二级学科进行人才培养，其中“控制理论与控制工程”是新疆大学重点学科。学科在洁净能源利用、智能控制等领域具有较突出的特色。

主要学科研究方向一：控制理论与控制工程

本研究方向以复杂系统为主要对象，以数学方法和计算机技术为主要工具，研究各种控制策略及控制系统的理论、方法和技术。研究内容：复杂系统的建模、控制、优化、决策与仿真；鲁棒控制与非线性控制；工程系统的综合控制与优化；运动控制系统设计与分析；先进控制理论与方法。

主要学科研究方向二： 检测技术与自动化装置

本研究方向以自动化装备及生产自动化过程为对象，研究内容：电力系统智能检测与智能信息处理、虚拟仪器与软测量技术、嵌入式系统与智能仪器仪表、现场总线技术及应用、智能控制理论及其应用、过程控制与应用、自动化控制设备与装置。

主要学科研究方向三： 模式识别与智能系统

本研究方向以复杂系统信息为对象，研究内容：模式识别与计算机视觉、图形机器学习与智能信息处理、自适应信号处理与多传感信息融合、环境感知与交互领域理论与方法、复杂制造系统信息源知识发现和表示、先进机器人控制与智能机器等。